Malarz i grafik; studiował na krakowskiej ASP u J. Mehoffera (1903-1905); w 1906 wyjechał na dalsze studia do Wiednia, gdzie został członkiem stowarzyszenia artystycznego “Hagenbund” (1907); w 1909 zamieszkał w Paryżu, gdzie przemożny wpływ wywarli na niego zarówno dawni, jak i nowi klasycyści - Nicolas Poussain, Claude Lorrain, ale także Puvis de Chavannes, Cézanne czy Picasso. W 1914 wrócił do Wiednia, gdzie zgłosił się jako ochotnik do armii austriackiej; w wyniku poważnej rany głowy utracił wzrok na kilka miesięcy; w l. 1938-1972 mieszkał we Francji, by u schyłku życia powrócić do Austrii; Jerzy Merkel od 1945 był członkiem, a później honorowym członkiem Wiedńskiej Secesji; w 1961 otrzymał Nagrodę Miasta Wiednia w kategorii sztuk plastycznych. Zoną artysty była malarka Louise Merkel-Romée (1888–1977). W 198 nazwiskiej artysty nazwano jedną z ulic w 22. Bezirku Wiednia (Merkelgasse).

Österreichische Galerie Belvedere, Wiedeń; Kunstmuseum Linz, Austria; Kölnischer Kunstverein, Kolonia; Essl Museum Klosterneuburg, Austria.